研究構(gòu)建綜合性的新生RNA數(shù)據(jù)庫----中國(guó)科學(xué)院

加快打造原始創(chuàng)新策源地，加快突破關(guān)鍵核心技術(shù)，努力搶占科技制高點(diǎn)，為把我國(guó)建設(shè)成為世界科技強(qiáng)國(guó)作出新的更大的貢獻(xiàn)。

——習(xí)近平總書記在致中國(guó)科學(xué)院建院70周年賀信中作出的“兩加快一努力”重要指示要求

面向世界科技前沿、面向經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場(chǎng)、面向國(guó)家重大需求、面向人民生命健康，率先實(shí)現(xiàn)科學(xué)技術(shù)跨越發(fā)展，率先建成國(guó)家創(chuàng)新人才高地，率先建成國(guó)家高水平科技智庫，率先建設(shè)國(guó)際一流科研機(jī)構(gòu)。

——中國(guó)科學(xué)院辦院方針

首頁 > 科研進(jìn)展

研究構(gòu)建綜合性的新生RNA數(shù)據(jù)庫

2025-07-14 廣州生物醫(yī)藥與健康研究院

【字體：大中小】

語音播報(bào)

近日，中國(guó)科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院研究員鮑習(xí)琛團(tuán)隊(duì)收集并整理了涵蓋22個(gè)物種、415項(xiàng)研究的3664個(gè)新生RNA測(cè)序數(shù)據(jù)集，構(gòu)建了綜合性的新生RNA數(shù)據(jù)庫NaRaDa，并提供樣本質(zhì)控信息，以確保用戶可篩選高質(zhì)量數(shù)據(jù)集。進(jìn)一步，NaRaDa鑒定了558574個(gè)來自不同物種的轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件，用戶可通過感興趣的基因來探索，也可通過篩選具有特定處理或?qū)嶒?yàn)條件的項(xiàng)目來獲取其對(duì)應(yīng)調(diào)控元件。同時(shí)，NaRaDa支持用戶在線分析不同新生RNA數(shù)據(jù)集的轉(zhuǎn)錄調(diào)控變化，包括新生RNA表達(dá)差異、RNA聚合酶的暫停/釋放轉(zhuǎn)變以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件的活躍程度變化。用戶可下載并利用上述信息，深入剖析基因和調(diào)控元件在各種情況下的轉(zhuǎn)錄動(dòng)力學(xué)。

該研究構(gòu)建了綜合性的新生RNA數(shù)據(jù)庫，為解析轉(zhuǎn)錄起始變化、RNA代謝動(dòng)力學(xué)及基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了資源庫。

相關(guān)研究成果以NaRaDa: A comprehensive nascent RNA database為題，發(fā)表在The Innovation Life上。研究工作得到國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)、科學(xué)技術(shù)部等的支持。

論文鏈接

NaRaDa的整體框架

動(dòng)態(tài)解析基因組轉(zhuǎn)錄調(diào)控是解讀細(xì)胞命運(yùn)和疾病發(fā)生機(jī)制的關(guān)鍵。然而，傳統(tǒng)RNA測(cè)序技術(shù)受限于高豐度穩(wěn)態(tài)RNA，難以捕捉轉(zhuǎn)錄活動(dòng)的即時(shí)變化。近年來，新生RNA測(cè)序技術(shù)成為實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)轉(zhuǎn)錄動(dòng)態(tài)的關(guān)鍵工具。相較于傳統(tǒng)RNA測(cè)序技術(shù)，新生RNA測(cè)序技術(shù)可從新生RNA即時(shí)表達(dá)情況、轉(zhuǎn)錄暫停情況及非編碼轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件的活躍情況三個(gè)層面提供轉(zhuǎn)錄調(diào)控信息。近日，中國(guó)科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院研究員鮑習(xí)琛團(tuán)隊(duì)收集并整理了涵蓋22個(gè)物種、415項(xiàng)研究的3664個(gè)新生RNA測(cè)序數(shù)據(jù)集，構(gòu)建了綜合性的新生RNA數(shù)據(jù)庫NaRaDa，并提供樣本質(zhì)控信息，以確保用戶可篩選高質(zhì)量數(shù)據(jù)集。進(jìn)一步，NaRaDa鑒定了558574個(gè)來自不同物種的轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件，用戶可通過感興趣的基因來探索，也可通過篩選具有特定處理或?qū)嶒?yàn)條件的項(xiàng)目來獲取其對(duì)應(yīng)調(diào)控元件。同時(shí)，NaRaDa支持用戶在線分析不同新生RNA數(shù)據(jù)集的轉(zhuǎn)錄調(diào)控變化，包括新生RNA表達(dá)差異、RNA聚合酶的暫停/釋放轉(zhuǎn)變以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件的活躍程度變化。用戶可下載并利用上述信息，深入剖析基因和調(diào)控元件在各種情況下的轉(zhuǎn)錄動(dòng)力學(xué)。該研究構(gòu)建了綜合性的新生RNA數(shù)據(jù)庫，為解析轉(zhuǎn)錄起始變化、RNA代謝動(dòng)力學(xué)及基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供了資源庫。相關(guān)研究成果以NaRaDa: A comprehensive nascent RNA database為題，發(fā)表在The Innovation Life上。研究工作得到國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)、科學(xué)技術(shù)部等的支持。論文鏈接NaRaDa的整體框架

打印