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加快打造原始創(chuàng)新策源地,,加快突破關(guān)鍵核心技術(shù),努力搶占科技制高點,為把我國建設(shè)成為世界科技強國作出新的更大的貢獻。

——習(xí)近平總書記在致中國科學(xué)院建院70周年賀信中作出的“兩加快一努力”重要指示要求

面向世界科技前沿,、面向經(jīng)濟主戰(zhàn)場,、面向國家重大需求,、面向人民生命健康,,率先實現(xiàn)科學(xué)技術(shù)跨越發(fā)展,,率先建成國家創(chuàng)新人才高地,,率先建成國家高水平科技智庫,率先建設(shè)國際一流科研機構(gòu),。

——中國科學(xué)院辦院方針

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【中國科學(xué)報】新研究實現(xiàn)億原子級拉曼光譜量子力學(xué)模擬

2025-01-02 中國科學(xué)報 王敏
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中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)教授商紅慧,、楊金龍團隊與中國科學(xué)院計算技術(shù)研究所高級工程師劉穎、華東師范大學(xué)教授何曉等團隊合作,,實現(xiàn)了億原子級拉曼光譜量子力學(xué)模擬,。該成果成功入圍2024年“戈登貝爾獎”,。

“戈登貝爾獎”是國際高性能計算應(yīng)用領(lǐng)域最高獎,,由美國計算機協(xié)會頒發(fā),旨在表彰世界范圍內(nèi)高性能計算的杰出成就,,尤其是高性能計算應(yīng)用于科學(xué),、工程和大規(guī)模數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域的創(chuàng)新工作。

拉曼光譜是研究分子結(jié)構(gòu)的重要工具,,被廣泛應(yīng)用于藥物開發(fā),、疾病診斷等領(lǐng)域,然而拉曼光譜量子模擬計算量巨大,。此前的拉曼光譜量子模擬僅能處理數(shù)千原子的小體系,。

在上述研究中,,聯(lián)合團隊在算法設(shè)計和工程技術(shù)方面進行了多項創(chuàng)新,開發(fā)了一款QF-RAMAN程序,,首次實現(xiàn)了包含1億多原子的新冠病毒刺突蛋白在水溶液中的拉曼光譜量子模擬,,與以往工作相比實現(xiàn)了4至5個數(shù)量級的提升。此外,,QF-RAMAN程序設(shè)計了彈性任務(wù)卸載技術(shù),,通過小規(guī)模運算的靈活聚合,大幅提高異構(gòu)加速器的硬件利用率,。同時,,該程序采用OpenCL通用異構(gòu)并行計算框架,能在不同硬件架構(gòu)的超級計算機上,,借助OpenCL編譯工具鏈實現(xiàn)跨平臺運行,。在此基礎(chǔ)上,團隊提出了適用于億級原子體系的矩陣方程求解拉曼光譜的新算法,,有效解決了大規(guī)模量子力學(xué)拉曼模擬中的關(guān)鍵技術(shù)難題,。

該研究表明,量子力學(xué)模擬可以擴展到前所未有的規(guī)模,,為高性能計算與科學(xué)研究的深度融合奠定了堅實的技術(shù)基礎(chǔ),,推動生物分子高階量子力學(xué)物理性質(zhì)模擬研究進入新階段,為理解復(fù)雜生物系統(tǒng)開辟了新途徑,。

相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1109/SC41406.2024.00011

(原載于《中國科學(xué)報》?2025-01-02?第3版?綜合)

打印 責(zé)任編輯:梁春雨

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